– mutacje niekorzystne – zmniejszają zdolność przystosowawczą do środowiska, są letalne lub półletalne;
– mutacje korzystne – zwiększają zdolności adaptacyjne organizmu do środowiska;
– mutacje neutralne – nie mają wpływu na zdolności przystosowawcze organizmu do środowiska, gdyż na ogół nie ujawniają się w fenotypie (mogą mieć charakter milczących mutacji punktowych, zachodzić w częściach intronowych genów, prowadzić do powstawania tzw. pseudogenów lub dotyczyć materiału genetycznego pseudogenów); są ważne z punktu widzenia ewolucji organizmów.