Rośliny
Drzewa
Cis pospolity, limba, brzoza ojcowska, jarząb szwedzki.
Krzewy i krzewinki
Kosodrzewina, brzoza niska i karłowata, wierzba lapońska, wiśnia karłowata, bluszcz pospolity, sosna błotna, woskownica europejska, wierzba borówkolistna, malina moroszka, szczodrzeniec zmienny, wawrzynek wilczełyko i główkowy, rokitnik zwyczajny, kłokoczka południowa, różanecznik żółty, chamedafne północna, wrzosiec bagienny, wiciokrzew pomorski, zimoziół północny.
Częściowa ochrona: porzeczka czarna, wilżyna ciernista, kruszyna pospolita, bagno zwyczajne, mącznica lekarska, kalina koralowa.
Rośliny zielne
Widłaki, gożdziki ( prócz gozdzika kartuzka i kropkowanego), orlik pospolity, miłek wiosenny, grążel żółty i drobny, rojniki, rosiczki, naparstnica zwyczajna, goryczki ( trójeściowa-częściowa), barwinek pospolity, szarotka alpejska, arnika górska, kosaćce (prócz kosaćca żółtego), ostnice, storczykowate, salwinia pływająca, skrzyp olbrzymi, długosz królewski, pióropusznik strusi, podrzeń żebrowiec, języcznik zwyczajny, poryblin jeziorny i kolczasty, łyszczec wiechowaty, lepnica litewska, pełnik europejski, pluskwica europejska, orlik pospolity, tojad, powojnik prosty, sasanki, zawilec narcyzowy i wielkokwiatowy, miłek wiosenny, warzucha polska, parzydło leśne, ostrołódka kosmata, groszek wschodniokarpacki, kotewka- orzech wodny, len złocisty i włochaty, dyptam jesionolistny, mikołajek nadmorski, arcydżięgiel litwor, mlecznik nadmorski, żmijowiec czerwony, pierwiosnka omączna, pomocnik baldaszkowy, wielosił błękitny, lulecznica kraińska, gnidosz królewski i rozesłany, niebielistka trwała, grzybieńczyk wodny, dziewięćsił bezłodygowy i popłocholistny, ostrożeń pannoński, zerwa kulista, wężymord stepowy, kosatka kielichowa, pajęcznica liliowata, lilia złotogłów, szachownica kostkowa, śniedek cienkolistny i baldaszkowaty, szafirek miękkolistny i drobnokwiatowy, śnieżyca wiosenna, śnieżyczka przebiśnieg, mieczyk błotny i dachówkowaty, szafran spiski, turówka wonna.
Częściowa ochrona: paprotka zwyczajna, kopytnik pospolity, grzybienie białe i północne, pierwiosnka wyniosła i lekarska, pokrzyk wilcza jagoda, kocanki piaskowe, ciemiężyca biała, zielona i czarna, zimowit jesienny, konwalia majowa, turzyca piaskowa, turówka leśna, marzanka wonna, naparstnica purpurowa, centuria pospolita.
Grzyby
Smardze, szmaciak gałęzisty, soplówka gałęzista i jodłowa, modrzewnik lekarski, flagowiec olbrzymi, żagwica listkowata i okółkowa, szyszkowiec szyszkowaty, podgrzybek pasożytniczy, purchawka olbrzymia, sromotnikowate.
Porosty
Ochrona częściowa: płucnica islandzka, granicznik płucnik, wszystkie gatunki brodaczka.
Zwierzęta
Owady
Modliszka zwyczajna, tęczniki, biegacze, jelonek rogacz, wynurt, sichrawa karpacka, koziróg dębosz i bukowiec, nadobnica alpejska, mieniak strużnik i tęczowiec, paż królowej i paz żeglarz, niepylak apollo i mniemozyna, trzmiele, zmierzchnica trupia główka, krasa kaja, pawica gruszówka.
Ryby
Jesiotr zachodni, strzeble, ciosa, kiełb białopłetwy i długowąsy.
Płazy
Salamandra plamista, traszki (np. grzebieniasta, zwyczajna), ropuchy (np. zwyczajna, zielona, paskówka), kumaki (np. nizinny), huczek ziemny, rzekotka drzewna, grzbiuszka ziemna.
Gady
Żółw błotny, jaszczurki (np. padalec zwyczajny, zwinka, żyworodna), węże (np. zaskroniec zwyczajny, gniewosz plamisty, żmija zygzakowata).
Ptaki
Nurowate, perkozowate, wiosłonogie, brodzące ( prócz czapli siwej), blaszkodziobe ( łabędzie i tracze), wszystkie drapieżne, chruściele ( prócz łyski), żuraw popielaty, ostrygojad, kulon, siewki, brodżce (np. krwawodzioby, piskliwy, samotny), biegusy ( prócz bataliona, słonki, bekasa kszyka, bekasika, bekasa dubelta), szczudłaki, płatkon ogie, żwirowce, wydrzyki, mewy, alki, rybitwy, gołębiowate ( prócz gołębia grzywacza), kukułki, lejka kozodoja, sowy, jerzyk, dzięcioły, kraski, wróblowate ( prócz wrony, sroki, gawrona, kawki, wróbla, wróbla mazurka).
Dodatkowo w okolicach Torunia: perkozek, perkoz rdzawoszyi, perkoz dwuczuby, bąk, bączek, czapla siwa, bocian biały, bocian czarny, gęś gęgawa, łabędz niemy, świstun, krakwa, rożeniec, podgorzałka, ogorzałka, głowienka, czernica, płaskonos, gągoł, nurogęś, kania czarna, kania rdzawa, błotniak stawowy, krogulec, myszołów, orlik krzykliwy, kobuz, pustółka, bielik, sieweczka obrożna, sieweczka rzeczna, żuraw, bordziec krwawodzioby, bordziec piskliwy, brodziec samotny, czajka, biegus zmienny, śmieszka, mewa pospolita, mewa żółtonoga, mewa srebrzysta, mewa siodłata, rybitwa zwyczajna, rybitwa białoczelna, rybitwa czarna, sierpówka, turkawka, lelek kozodój, kukułka, puszczyk, płomykówka, sowa uszata, pójdzka, jerzyk, zimorodek, dudek, krętogłów, dzięcioł zielony, dzięcioł czarny, dzięcioł pstry, dzięciołek, dzierlatka, dzięcioł średni, skowronek polny, skowronek borowy, brzegówka, dymówka, oknówka, świegotek drzewny, świegotek łąkowy, pliszka żółta, pliszka siwa, jemiołuszka, strzyżyk, pokrzywnica, rudzik, słowik szary, kopciuszek, pleszka, pokląskwa, białorzydka, kos, kwiczoł, śpiewak, paszkot, strumieniówka, brzęczka, rokitniczka, łozówka, trzcinniczek, trzciniak, zaganiacz, pokrzywka jarzębata, piegza, cierniówka, pokrzewka ogrodowa, pokrzewka czanołbista, świstunka, pierwiosnek, piecuszek, mysikrólik, muchołówka szara, muchołówka żałobna, sikora bogatka, sikora modra, sikora czarnogłowa, sikora uboga, sikora czubata, kowalik, pełzacz ogrodowy, pełzacz leśny, remiz, wilga, gąsiorek, kruk, zięba, kulczyk, dzwoniec, szczygieł, czyż, makolągwa, dziwionia, gil, grubodziób, trznadel, ortolan, potrzos.
Ssaki
Jeże, krety, ryjówki (np. aksamitna, malutka), nietoperze (np. nocek duży, nocek Natterera, nocek wąsatek, nocek łydkowłosy, nocek rudy, gacek wielkouch, mopek, mroczek póżny, karlik malutki, karlik większy, borowiec większy), zając bielak, rzesorek rzeczek, świstak, susły, bobry, smużka, popielicowate, walenie, gronostaj, niedżwiedż brunatny, łasica, norka europejska, żbik, płetwonogie, kozica, żubr, wilk, wydra.