Bakterie rozmnażają się przez podział bezpośredni komórki, czyli na drodze amitozy. Proces ten prowadzi do wzrostu liczebności bakterii w populacji. Zachodzi do momentu wyczerpania się składników odżywczych w środowisku. W niesprzyjających warunkach niektóre bakterie, np. laseczki maczugowców, mogą wytwarzać formy przetrwalnikowe zwane endosporami, które w stanie życia utajonego, czyli anabiozy, mogą przetrwać wiele lat. Rozmnażanie bezpłciowe nie zapewnia bakteriom wymiany materiału genetycznego.
Proces wymiany DNA odbywa się w wyniku koniugacji, transformacji lub transdukcji.
Koniugacja polega na wymianie części genoforu lub plazmidów poprzez fimbrie między dwiema komórkami bakterii.
Transformacja odbywa się poprzez pobranie z podłoża DNA pochodzącego z martwych bakterii i wbudowanie go we własny materiał genetyczny.
Transdukcja zachodzi, gdy fragment DNA zostanie przeniesiony z jednej komórki do drugiej za pośrednictwem wirusa bakteryjnego.