Formuła Toyota

Hiszpan karierę rozpoczął w roku 1998, od startów w kartingu. W 2000 roku przeszedł do wyścigów samochodów jednomiejscowych, debiutując w Hiszpańskiej Formule Toyota 1300. Już w pierwszym podejściu sięgnął w niej po tytuł mistrzowski, zwyciężając w czterech wyścigach.

World Series by Nissan

W roku 2001 Borja awansował do serii World Series by Nissan. Stanąwszy w niej raz na podium, został sklasyfikowany na 10. miejscu. W kolejnym sezonie przeniósł się do Formuły Nissan 2000. W ciągu czternastu wyścigów, sześciokrotnie meldował się w pierwszej trójce, z czego dwukrotnie na najwyższym stopniu. Ostatecznie zmagania zakończył na 3. pozycji.

Formuła 3

W latach 2002–2004 Garcia brał udział w Hiszpańskiej Formule 3 (reprezentował ekipę Racing Engineering). Po dwukrotnym zajęciu trzeciego miejsca w klasyfikacji generalnej, w ostatnim roku startów zdominował rywalizację, zwyciężając w dziewięciu z czternastu wyścigów. Hiszpan wziął udział również w jednej rundzie Formuły Lliure. Okazał się najlepszy, jednakże nie był liczony do ogólnej punktacji.

Seria GP2

Dzięki sukcesom w hiszpańskiej F3, Borja dostał szansę startów w hiszpańskiej stajni, w bezpośrednim przedsionku Formuły 1 – serii GP2. W pierwszym roku startów pięciokrotnie dojeżdżał na punktowanych lokatach, dwukrotnie przy tym stając na podium (w sobotnich zmaganiach, w Turcji, zajął trzecie miejsce, natomiast w niedzielnym wyścigu, w Belgii, był drugi). Ostatecznie został sklasyfikowany na 14. pozycji.

W sezonie 2007 przeniósł się do włoskiej stajni Durango. W ciągu dwudziestu jeden wyścigów, dziewięciokrotnie sięgał po punkty, na najlepszym uzyskując dwukrotnie czwartą lokatę (w sprintach, na torze Sakhir oraz Ricardo Tormo). Zdobyte punkty pozwoliły Garcii w zajęciu 10. miejsca, w końcowej klasyfikacji.

World Series by Renault

W 2006 roku startował w barwach ekipy RC Motorsport, w Formule Renault 3.5. Równa i konsekwentna jazda zaowocowała tytułem wicemistrzowskim, z zaledwie pięcioma punktami straty do triumfatora Alxa Danielssona. W ciągu sezonu siedmiokrotnie stawał na podium, w tym raz na najwyższym stopniu (w drugim wyścigu, w Belgii).

Dwa lata później wystartował w trzech pierwszych eliminacjach, ponownie reprezentując włoski zespół. Biorąc udział w pięciu wyścigach, tylko w jednym sięgnął po punkty, zajmując szóste miejsce w inauguracyjnym wyścigu, na włoskim torze Monza. Zdobyte punkty dały mu w ogólnej punktacji 24. lokatę.

Formuła Atantic

W sezonie 2009 ścigał się w amerykańskiej serii Formuła Atlantic. Wystąpiwszy w dziesięciu wyścigach, zmagania zakończył na 7. miejscu.

Superleague Formula

W roku 2008 zadebiutował w nowo powstałej serii Superleague Formula. Reprezentując hiszpański klub Sevilla FC (zespół GTA Motor Competición), raz sięgnął po zwycięstwo, odnosząc je podczas niedzielnej rywalizacji, na obiekcie Donington Park. Ostatecznie został sklasyfikowany na 10. pozycji.

W 2010 roku wystąpił w pierwszych pięciu rundach, ścigając się dla portugalskiego klubu Sporting CP (ekipa Atech GP/Reid Motorsport). W ciągu dziesięciu wyścigów, osiem razy zdobył punkty, na najlepszym dwukrotnie uzyskując piątą pozycję. W ten też sposób wspomógł swój zespół w zajęciu 15. miejsca, w generalnej klasyfikacji.